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  • 【转载】K-mer算法2019-06-21 13:39:54

    k-mer是指将reads分成包含k个碱基的字符串,一般长短为m的reads可以分成m-k+1个k-mers.举个例子吧,为了简化,有这么个reads(当然实际比这个长):AACTGACTGA.如果k-mer的k为3的话,我们可以将其切割为AAC ACT CTG TGA GAC ACT CTG TGA.我们将这些k-mers放入计算机中拼接,假设第一个为TGA ,那么

  • insert size|single-read|Paired-end|Mate-pair2019-06-20 19:41:20

    (测序方面):测三只大熊猫;得到的insert size有150bp,500bp,2kb,5kb和10kb这四种,可测得序列长度和平均reads长度。 为什么average reads这么短? 因为insert size是打断前的长度,打断之后便是reads,这里计算average reads长度。 shotgun sequencing鸟枪法:直接从生物细胞基因组中获取目的基因的

  • 事务传播和隔离2019-03-09 15:42:15

    第一次被问到这个问题是面试Oracle的时候. 第二次被问到是面试某云的时候.  复习一下:  这个问题的答案可以看Sping的annontation @Transactional. 有个配置节点:  Propagation: 传播Isolation: 隔离 传播这种东西吧, 怎么说呢, 代码规范得好一点, 就不会频繁碰见. 耦合太多,A

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