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高通量测序的三个基本概念

2021-08-12 12:32:22  阅读:322  来源: 互联网

标签:contigs 测序 reads 拼接 序列 高通量 基本概念


 

1. Reads

高通量测序所产生的序列

2. Contig

拼接软件基于reads间的重叠区,拼接而得到的序列,contig也叫重叠群。

3. Scaffold

基因组de novo 测序,通过reads拼接得到contigs,再构建454-paired-end 库或illumina mate-pair库,以获得一定大小片段两端的序列。基于这些序列进而确定contigs之间的顺序关系,我们把contigs顺序明确的组成称为scaffold.

标签:contigs,测序,reads,拼接,序列,高通量,基本概念
来源: https://www.cnblogs.com/Tsuimm/p/15132134.html

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