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  • rpy2 安装失败 Microsoft Visual C++ 14.0 is required2021-06-04 10:51:49

    安装代码 pip install rpy2 安装报错 显示C++ 14.0 required copying .\rpy\ipython\tests\__init__.py -> build\lib.win-amd64-3.6\rpy2\ipython\tests running build_clib building 'r_utils' library error: Microsoft Visual C++ 14.0 is requi

  • python-rpy2负二项式glm2019-11-18 17:57:13

    我正在尝试从rpy2调用R glm.nb: from rpy2 import robjects from rpy2.robjects.packages import importr MASS = importr('MASS') stats = importr('stats') def glm_nb(x,y): formula = robjects.Formula('y~x') env = formula.environme

  • 使用rpy2设置网格图选项时出现问题2019-11-05 14:05:34

    我正在尝试使用numpy数组中的数据,使用rpy2和点阵来创建热图或颜色强度图.我正在使用python 2.6.2,R 2.10.1,rpy2 2.1.9,不确定是哪个版本的grid.我已经使其工作完美,除了我需要修改用于绘制相关变量(z)级别的色带的默认晶格设置.具体来说,我要使用灰度而不是品红色-青色默认渐变.

  • python-在rpy2中处理Null返回2019-10-31 19:59:38

    我正在使用rpy2从python调用R函数. from rpy2.robjects import * result=r.someFunctioninR() #someFunctioninR is a R function written by myself if result==r('as.null()'): do something else: do something else someFunctioninR()返回的“结果”可以为NULL或

  • 从R到rpy2的逻辑回归2019-10-29 18:57:31

    我正在尝试使用ryp2进行逻辑回归.我设法执行了它,但是不知道如何从结果中提取系数和p值.我不想在屏幕上打印这些值,而是要创建一个函数来独立使用它们. import rpy2.robjects as ro mydata = ro.r['data.frame'] read = ro.r['read.csv'] head = ro.r['head'] summary = ro.r['sum

  • 在python中使用pickle时发生内存泄漏2019-10-27 15:57:20

    我有一个很大的泡菜文件,其中包含数百个经过训练的python r模型:这些是使用rpy2库构建的统计模型. 我有一个类,每次调用它的一个方法时都会加载该pickle文件(该方法在循环中多次调用). 碰巧,即使没有引用指向加载的内容,也无法释放加载pickle文件内容所需的内存(大约100 MB).我正确

  • rpy2传递python保留关键字参数2019-10-26 08:57:35

    我正在尝试通过python使用r的密度函数,并且必须将’from’,’to’参数传递给密度函数.但是,由于单词“ from”是python中保留的ketyword,如何实现? 谢谢.这是到目前为止的代码. r_density=robjects.r('density') f_a = robject.FloatVector(a) r_a = r_density(f_a, bw='SJ', n=102

  • Python和rpy2:如何在运行时调整/清除图形?2019-10-24 02:07:50

    我正在使用rpy2在python中进行数据分析和绘图.它工作正常,除了以下事实:当我绘制图时,它的窗口一直挂着,直到程序终止.有没有办法在运行时清除情节?此外,如果我调整了窗口的大小,该图将消失,但窗口将保留.交互使用R时,调整窗口大小仅会调整图的大小.我想在python中具有此功能. 例如,

  • 如何使用python和rpy2控制显示R图的位置?2019-10-23 15:07:03

    我正在用Python编写程序.发生的第一件事是显示的窗口(我正在使用wxPython)具有一些按钮和文本.当用户执行某些操作时,图将显示在其自己的窗口中.该图是使用Rpy2用R绘制的.问题在于,通常会在主窗口顶部弹出图,因此用户必须移动图才能再次看到主窗口.对于用户而言,这是一个大问题,因

  • python-用rpy发送到X11的图突然关闭了吗?2019-10-09 09:56:12

    我正在使用RPy2作图.显示该图,但X11窗口立即消失. 我要输入的内容如下,其中CCFS是数据矩阵 import rpy2.robjects as robjects r = robjects.r pca = r.princomp(CCFS) r.plot(pca,main="Eigenvalues") r.biplot(pca,main="biplot") r['dev.off']() #*EDIT* the problem p

  • 使用rpy2为R准备一个python字符串2019-10-02 11:55:50

    这个问题与python variable to R有关,也许也与python objects to rpy2有关,但两者完全没有重叠,第一个实际上没有答案. 我的问题其实很简单.我有一个字符串,说: In [21]: strg Out[21]: 'I want to go home' 我想通过robjects.r(”””)将它传递给R,例如: robjects.r(''' test <-

  • python – 安装rpy2时遇到错误:尝试猜测R的HOME但PATH中没有R命令2019-09-29 00:57:18

    我在这里和其他地方看到过很多关于这个错误的帖子,但是所提出的解决方案似乎都没有相关性.我在Python 2.7.9,我有an R executable in my path,我正在尝试将它安装在不在Windows上的RHEL服务器上. 这是我看到的具体错误.有没有人知道是什么原因导致它或如何解决它?谢谢! $pip install

  • python – LD_LIBRARY_PATH优先级和编译问题2019-09-01 23:50:44

    我试图在Linux机器上安装一些软件(python的rpy2包,特别是rpy2.robjects,如果重要的话).我需要软件在我的本地空间中查找它的共享库,而不是像/usr/lib64这样的全局空间.我没有这台机器的管理员权限.我的问题是,即使我将LD_LIBRARY_PATH设置为指向我的本地空间,软件仍会转到/usr/lib6

  • ggplot2地狱与rpy2-2.0.7 python 2.6 r 2.11(Windows 7)2019-08-27 09:57:13

    我正在使用rpy2-2.0.7(我需要使用它来处理Windows 7,并为新的rpy2版本编译二进制文件是一团糟)将两列数据帧推入r,在ggplot2中创建几个层,并输出将图像转换为< .png>. 我浪费了无数个小时来熟悉语法;我确实设法输出了我需要的文件,但是(愚蠢地)没有注意到并继续烦恼我的代码…… 我

  • python – pandas.rpy.common.load_data()用法/文档?2019-08-25 03:58:34

    我正在尝试转换一些< class'rpy2.robjects.vectors.Matrix'>变量进入Pandas数据帧. 在互联网上有很多关于如何这样做的复制粘贴说明,所有这些都给出了简短的例子: pandas.rpy.common.load_data("infert") 没有关于“感染”来自哪里的任何信息. 我无法得到关于这个函数的任何文档(

  • python – Rpy2&ggplot2:LookupError’print.ggplot’2019-07-16 19:55:45

    不受任何已有的R,Rpy2和ggplot2知识的阻碍,我绝不会喜欢用Python创建一个普通表的散点图. 为此设置我刚刚安装: > Ubuntu 11.10 64位 > R版本2.14.2(来自r-cran镜子)> ggplot2(通过R> install.packages(‘ggplot2’))> rpy2-2.2.5(通过easy_install) 在此之后,我能够使用ggplot2从交

  • python – 将R升级到3.0.1后rpy2无法正常工作2019-07-14 19:56:36

    我有一个内部使用rpy2的python脚本.这个脚本一直工作到最近.但是,它现在停止了工作.我收到了一个我以前没见过的错误.我可以使用以下代码行重现错误: $python Python 2.6.1 (r261:67515, Jun 24 2010, 21:47:49) [GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5646)] on darwin Type "help", "cop

  • 在Python中导入RPy2中的包时,如何禁止输出到控制台?2019-07-13 17:57:04

    每当我在Python中使用RPy2中的导入运行导入包的脚本时,控制台中总会弹出一些额外的行.我粘贴在下面的一个例子中.我该怎样抑制这种行为? CookieJar:r cookies$python script.py ‘tseries’ version: 0.10-24 ‘tseries’ is a package for time series analysis and co

  • linux – 如何使用默认的R安装通过conda安装rpy22019-07-11 17:00:23

    我在Ubuntu linux上使用Anaconda Python发行版,并希望在IPython笔记本中使用R magics.有没有办法用conda发行版安装rpy2并在/usr/bin/R使用我当前的默认R安装?我的目标是保持当前的R安装,而无需通过conda安装R或其他R软件包. 这个response to a related question建议在mac上使用配方

  • python – RPy的多处理安全吗?2019-07-10 03:59:12

    在多处理环境中调用RPy函数是否安全,是否存在人们应该注意的关于RPy的任何多处理问题? 一个简单的例子可能如下: from multiprocessing import Pool from rpy import * def f(x): return r.mean(x) if __name__ == '__main__': p = Pool(5) print sum(p.map(f, [rang

  • python – rpy2转换矩阵 – > DataFrame2019-07-04 20:56:47

    我对这个看似简单的操作有困难,我认为这个操作先前已经解决但我找不到任何例子. 在R环境中,@ data是DataFrame类型,但是rpy2(2.2)返回一个Matrix.有没有一种方法可以将m转换为DataFrame或让robjects.r(查询)返回DataFrame? from rpy2.robjects.packages import importr import rpy2

  • 安装Enthought Canopy后安装python模块“rpy2”2019-07-03 20:46:03

    我的一些python脚本使用rpy2作为R的接口,它与之前的Enthought EPD python完美配合. 我最近从Enthought安装了Canopy Python. Python现在不再找到rpy2模块,当我尝试重新安装它时,我收到以下错误: $easy_install rpy2 [...] Processing rpy2-2.3.5.tar.gz Writing /var/folders/9n/

  • 使用rpy2映射python元组和R列表?2019-07-01 01:43:51

    我在理解rpy2对象和python对象的映射时遇到了一些麻烦. 我有一个函数(x)在python中返回一个元组对象,我想用R对象列表或向量映射这个元组对象. 首先,我正在尝试这样做: # return a python tuple into this r object tlist robjects.r.tlist = get_max_ticks(x) #Convert list int

  • python – 从rpy2 Random Forest对象获取字段值2019-06-24 06:46:17

    我正在尝试使用Python运行R Random Forest实现.我正在使用rpy2模块轻松完成这项工作.以下是随机生成数据的简单示例: import numpy as np from rpy2.robjects.numpy2ri import numpy2ri from rpy2.robjects.packages import importr from rpy2 import robjects as ro #create dat

  • python – rpy2:韩文字符不能在rpy2上运行2019-06-24 00:42:59

    python代码: import rpy2.robjects as robjects rCommand='''gender <- c("남자", "남자", "남자", "여자", "여자", "여자", "여자", "여자") age <- c(23, 25, 27, 29, 31, 33,

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