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  • Augustus 进行基因注释2020-02-25 09:03:41

    目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论,通过已有物种的注释信息对软件进行训练,从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构,在这方面做的最好的工具是AUGUSTUS它可以仅使用序列信息进行预测,也可以整合EST, cDNA, RNA-seq数据作为先验模型进行预测。 安装

  • 除了人以外,全世界最成功的物种是谁?2020-02-11 14:01:18

    新冠病毒还没褪去,最近湖南和四川又爆发了禽流感,而罪魁祸首——“鸡”,上万只都惨遭捕杀。今天,我们就深入看看“鸡”这个物种。 鸡的自然寿命是10~20年,但是在人类的干预下,从小鸡仔到做成烤鸡腿只需要6周,而且往往是发往全球各地。从单个鸡的命运来看,他是不幸的,但是从物种本身来

  • 2020第一本书《自私的基因》2020-01-29 13:41:01

     今天是大年三十,刚刚好在今天读完了这本《自私的基因》,印象中这本书已经被多次推荐到,但是也真的是无闲暇时间,还好2019末假期的归途是在火车上度过,还是硬座,那样的环境就像是头悬梁锥刺股,你无法安定的入座亦无法尽兴的闭眼休憩,所以还是拿出了我的移动图书馆开始阅读,有句话叫计

  • 生物学家:达尔文2019-11-10 11:51:49

    ylbtech-生物学家:达尔文 查尔斯·罗伯特·达尔文(Charles Robert Darwin,1809年2月12日—1882年4月19日),英国生物学家,进化论的奠基人。曾经乘坐贝格尔号舰作了历时5年的环球航行,对动植物和地质结构等进行了大量的观察和采集。出版《物种起源》,提出了生物进化论学说,从而摧毁了各

  • EST2019-11-01 20:03:47

    In genetics, an expressed sequence tag (EST) is a short sub-sequence of a cDNA sequence. ESTs may be used to identify gene transcripts, and are instrumental in gene discovery and in gene-sequence determination. EST作为表达基因所在区域的分子标签因编码DNA 序列

  • DIP|PCN|CoevDB|PID|Y2H|RosettaDock Serve|元基因组学|微生物多样性2019-10-01 21:50:44

    生命组学: 比较真核生物有关呼吸链的gene是比较核外编码基因,因为与呼吸有关的功能在线粒体上,线粒体位于核外。想要查看两种基因是否具有相互作用,可以对不同物种的编码ATP6 和ATP8的直系同源基因构建共进化树;可以绘制热图观察其区块化现象;可以计算相关系数;可以绘制箱图,进行类别之间

  • 未来你还在做这些工作,人工智能会让你无所事事。2019-07-22 10:56:15

    人工智能仍处于实验室的早期阶段,但阿尔法犬显示出惊人的智能,刺激了社会的敏感神经。商人敏锐的嗅觉突然意识到,一个新时代的大门已经打开,这是一个抓住野蛮增长机会的好机会。百度、华为、联想、阿里巴巴、微软等大公司集中投资数百亿美元和数百亿美元,积极策划并占据有利位置。人工智

  • Gene family|2019-07-03 22:02:42

    6.1引言 随着测序技术的提高,能被测序的物种趋近于复杂(因为越高等的生物基因组大且复杂(1.本身基因结构复杂2.复杂程度与种属关系并不相关)),所以基因家族(Gene family)的数目可能能够更好的评估物种的复杂性,更多的信息可以通过比较基因组学的方式得到。     基因家族(英语:Gene family),是

  • Between Us 3 人类的进化2019-06-22 16:01:23

    人类的进化   6500万年前,自然灾害消灭了恐龙,我们的祖先展开了适应辐射。板块构造的缓慢运动持续把欧亚大陆和美洲大陆拉开,扩大了大西洋的面积。灵长类动物占领了美洲大陆,由于被巨大的大西洋阻隔,美洲大陆的灵长类动物开始独立进化成了“新世界猴”。然后,大约在4500万年前,澳大利亚

  • 读《三体 Ⅰ》| 一个自我毁灭的物种2019-05-24 23:42:03

        如果要分析《三体》,讲自己的看法,不简单说下故事脉络是不行的,不然太像是一个人的狂欢,而其他人却不知前情提要,不知你在欢腾什么。即便是写给自己看的,自己已经熟知书中情节,但写出个概括,也是有好处的,至少你知道自己看进去了些什么。   『 故事的主角是一个叫汪淼的科学家,他在

  • 海龟交易法则13_系统2019-04-19 21:51:06

    海龟交易法则13:系统 世界上不存在完美的系统。奥米伽也许在某些市场状态下表现得更好,由于最有利于奥米伽的市场状态在过去一段时间一直占据主流,它在历史测试中的表现也许要远强于阿尔法系统。但遗憾的是,谁也不敢保证这样的市场状态在未来也会占据主流。 海龟交易法则13.1:不可

  • 蜜蜂和鱼700公里隔空“对话” 机器人协助实现跨物种交流2019-03-25 15:55:17

      近日,Science Robotics发表一篇由瑞士研究员发明的一款对话机器人,它能够使鱼和蜜蜂这两种几乎不可能“见面”的物种进行交流。研究结果表明,在多个物种的生物混合体中生成并控制行为模式是可行的,为新的人工集体智慧打开了大门。  没错!鱼和蜜蜂“打个电话”就能交流!  近日,

  • 利用metaphlan2结果计算alpha多样性2019-03-13 14:55:51

    利用metaphlan2结果计算alpha多样性前期回顾结果展示格式转化什么是α多样性什么是Shannon指数Shannon指数如何计算 前期回顾 MetaPhlAn2是分析微生物群落(细菌、古菌、真核生物和病毒)组成的工具,可以基于宏基因组数据,获得微生物群体中种水平精度的组成,包括细菌、古菌、真核生

  • 谁引发了区块链项目物种大爆发?2019-03-11 16:49:59

    在距今约5.2亿年前的寒武纪时期,在2000多万年的时间内,节肢、腕足、蠕形、海绵、脊索动物等一系列与现代动物形态基本相同的动物在地球上“集体亮相”,形成多种门类动物并存的繁荣景象。这一时期生物种类突然呈现出的爆发式增长,也就是“寒武纪生命大爆发”。 科学家对寒武纪物种

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