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  • 第十四章 遗传病的治疗2021-07-04 21:02:05

    第十四章  遗传病的治疗 遗传病的治疗包括传统治疗和基因治疗两种方法,手术治疗、药物治疗、饮食疗法是遗传病的治疗的传统方法,这些方法可以取得一定疗效,但不能根治。而基因治疗是运用重组DNA技术,将具有正常基因及其表达所需的序列导入到病变细胞或体细胞中,以替代或补偿缺陷基

  • 本周最新文献速递202107042021-07-04 15:58:03

    本周最新文献速递20210704 一、精细解读文献 一 文献题目: Genetic drivers of m6A methylation in human brain, lung, heart and muscle 不想看英文题目: 人脑、肺、心脏和肌肉中 m6A 甲基化的遗传驱动因素研究 杂志和影响因子: Nat Genet (IF: 27.603; Q1) 研究意义: 全基因

  • 第十二章 免疫遗传学2021-07-03 10:33:46

    第十二章  免疫遗传学 免疫遗传学是免疫学与遗传学相互渗透发展起来的一门边缘学科,主要研究抗原、抗体及它们之间相互作用的遗传本质,基因重排产生免疫的多样性,免疫应答过程中的遗传调控和抗原、抗体、抗原受体、补体等各种免疫活性物质的基因调控以及免疫缺陷病的遗传学问

  • 第九章 生化遗传学2021-07-03 10:32:03

    第九章  生化遗传学 生化遗传学(biochemical genetics)是利用生物化学的原理和方法来研究遗传物质的理化特性,探讨遗传物质(基因)与遗传性状之间的代谢联系,从而阐明基因的基本功能及其调控过程;与之相应的是这一学科也为揭示由于基因突变而引发的代谢缺陷(或相关的疾病)提供了理论依据

  • 空间转录组 概述22021-06-27 23:35:07

    来自https://spatialtranscriptomics.com/workflow/  1. Histology 将准备好的新鲜冷冻组织切片放置于空间转录组芯片上。每个细胞中的RNA分子都包含着基因表达的信息。组织切片成像,以检索组织学信息。这样就可以看到一个细胞或一组细胞在组织中的位置。  2. The Array 空间转

  • 单细胞测序 基因调控网络 Gene regulatory networks2021-06-27 18:05:12

    单细胞测序 基因调控网络 Gene regulatory networks基因不是独立发挥作用的。相反,基因的表达水平是由与其他基因和小分子之间的复杂调控决定的。揭示这些调控作用是基因调控网络(GRN)推断方法的目标(SCENIC | 从单细胞数据推断基因调控网络和细胞类型)。 基因调控网络推断是基于对基因

  • 第一章2021-06-21 10:05:56

    1、中心法则: 2、种、属、科、目、纲、门、界 3、正向遗传学:通过表型去找基因型 蛋白——氨基酸序列改变——RNA序列——DNA序列——位置 4、反向遗传学:通过基因去找表型 基因序列不同——染色体位置——寻找表型变化  

  • 【豆科基因组】普通豆/菜豆/四季豆Common bean (Phaseolus vulgaris L.) 基因组2021-06-17 15:36:02

    目录研究一:G19833组装,2014NG研究二:BAT 93组装,2016 genome biology 菜豆属(Phaseolus L.)为同源二倍体作物,包含有80 多个物种,多数为野生种,仅有5 个栽培种,分别为普通菜豆(P. vulgaris L.)、多花菜豆(P. cocineus L.)、利马豆(P. lunatus L.)、丛林菜豆(P. dumosus L.)和宽叶菜豆(P. acutifolius

  • 教程 | 规模化物种同源基因分析 - orthofinder [上篇]2021-06-17 15:00:38

    写在前面 基因组测序项目已然是几乎所有课题组都可以负担的水平。相比于几年前火爆的通过转录组测序挖掘生物学问题策略,通过基因组,尤其是比较基因组分析,往往可以给我们带来更多确定性结果,如相比于近源物种A为何物种B的果皮更红?这完全有可能是特定家族成员扩张导致。这些问题,

  • 遗传算法简单入门2021-06-17 14:03:50

     接了一个算法设计,要用遗传算法去解决物流运输中的车辆安排,没学过这种算法,百度了一下,还是有难度的,虽然有很多资料,但是对于初学者还是太难,而且没有实例,根本就不是太理解,今天,我就拼凑一下我看过和我理解的知识,写个入门级的实例呗。     先来普及下,我认为比较简单的两个求最

  • AI与医学:AI预测结合医学案例应用——当基因编辑转角遇到AI2021-06-15 23:02:36

    AI与医学:AI预测结合医学案例应用——当基因编辑转角遇到AI 背景       今年生物医学领域十大预测中两项出乎意料!       一是没想到“基因编辑婴儿”诞生了!这让全球科学界为之哗然,媒体疯狂炒作了一番。另一项预测更让人沮丧:人工智能对医疗健康的影响并没有想象的那样惊天动

  • 【豆科基因组】绿豆基因组2014NC2021-06-15 13:01:50

    目录来源一、简介二、结果基因组组装重复序列和转座子基因组特征和基因注释绿豆的驯化豆科基因组复制历史基于转录组分析的豇豆属形成绿豆育种基因组资源三、讨论四、方法材料组装SNP/INDEL 分析和全基因组比对遗传图谱构建转座子(TE)检测和重复序列屏蔽基因预测和注释转录因子(TF)鉴

  • 字符串的分割2021-06-12 10:36:28

            基因工程总部需要让M个国家共同解码一段长度为M*L的基因序列。总部的想法很简单,把基因序列均匀分成连续的M段,每个国家各自选一段进行处理,各自的选择不允许重复。但是这些基因太长了,总部文员不知怎么办,请你帮他将序列分段并交给它们对应的国家。 输入       

  • 区间DP:基因拼接2021-06-02 11:32:15

    5(选做) 基因拼接 (100 分) 基因拼接是将不同的DNA片段连接在一起。现有n个DNA片段,从左到右排成一条直线。每次选取相邻的两个DNA片段,拼接成一条更长DNA片段。规定最后1个DNA片段和第1个DNA片段相邻。重复这个过程,直到所有的DNA片段形成一个DNA片段。每次拼接,花费的代价是所

  • 分享让人折服的优秀代码基因 ReviewBoard2021-06-02 09:34:05

      1 背景 近来参与一个较大团队的项目实施,项目的金额两千万,人数近百。但是,项目实施后,暴露出以下几个问题: (1)质量不佳,团队成员水平参差不齐,软件外部质量、内部质量一致性差; (2)需求不确定,时间非常紧,代码频繁修改,越来越丑,效率变低。 为了保证项目按时按质交付,质量改善刻不容缓。因此

  • dd爱科学1.0(牛客)2021-05-30 11:35:57

    题面: 链接:https://ac.nowcoder.com/acm/contest/11211/A来源:牛客网大科学家dddddd最近在研究转基因白菜,白菜的基因序列由一串大写英文字母构成,dddddd经过严谨的推理证明发现,只有当白菜的基因序列呈按位非递减形式时, 这株白菜的高附加值将达到最高,于是优秀的dddddd开始着手修改白菜

  • 最长非递减子序列(动态规划)2021-05-29 10:33:48

    题目:https://ac.nowcoder.com/acm/contest/11211/A 白菜的基因序列由一串大写英文字母构成,dddd经过严谨的推理证明发现,只有当白菜的基因序列呈按位非递减形式时,这株白菜的高附加值将达到最高,于是优秀的dddd开始着手修改白菜的基因序列,dddd每次修改基因序列的任意位需要的代价

  • 【干货+视频】生物医学影像处理、分布式系统与数据共享平台2021-05-28 18:58:52

    在过去的一年中,“RONG”系列论坛成功举办多场,“RONG”这一词语已成为清华大学数据科学研究院连接校内各院系间及校外资源的纽带。如今“RONG 2.0”带来的新一次思想碰撞又拉开了序幕。RONG系列论坛旨在促进校内外不同院系、不同学科间围绕大数据科研课题的相互认识、沟通交流,以促进

  • 【干货】徐葳:生物医学影像处理、分布式系统与数据共享平台2021-05-28 18:57:03

    本讲座选自清华大学交叉信息研究院助理教授徐葳于2015年11月26日在RONG v2.0---“图形图像处理与大数据技术”论坛上所做的题为《生物医学影像处理、分布式系统与数据共享平台》的演讲。徐葳:谢谢组织者的邀请,我不是做图形图像的,我是做分布式系统的,这是我的简要经历。我一方面在做科

  • 【揭秘】清华大数据思享会-精准医疗专场2021-05-28 16:04:36

    清华大数据思享会是面向清华大数据产业联合会成员的思想交流的平台,定位为小范围的深度交流,目标是希望通过思想交流与碰撞促进产业的数据创新。清华大数据思享会致力于建立联合会成员充分展示与共同进步的平台,促进大数据与产业和资本的融合。  2016年2月25日新春之后第一场思享会,

  • TCGA肿瘤基因数据的访问(二)2021-05-27 18:06:28

    TCGA(The Cancer Genome Atlas)项目完成后,最终和其它的一些肿瘤医学项目一起归档在 GDC Portal网站,方便人们访问。 网址是  https://portal.gdc.cancer.gov 其中除了TCGA的数据还有其它一些医学项目产生的基因测序数据,以及临床信息数据。 网站首页如下: 左侧可以点击Projects 根据

  • 什么是基因测序,为什么需要云计算2021-05-27 17:53:47

    【摘要】 唐老师写的技术入门文章,保证小白也能看懂。本文带你领略过去这100年中人类对基因的认识从无到有,并到当下即将进入寻常百姓家的发展历程,以及说明为什么基因测序和云计算会扯上关系。另,本文定位只是科普类文章,目的是带你入门基因测序技术,所以内容篇幅都不会很长。如果你对

  • 云计算,助力基因测序行业腾飞发展2021-05-27 10:59:26

    随着基因测序技术和测序市场的不断发展和成熟,基因测序对于普通百姓来讲也不再是一个完全陌生概念,应用领域从生育健康发展到遗传病诊断,再到肿瘤基因早筛和个人基因组测序。同时,测序市场规模近年来也呈现爆发式增长,据中商产业研究院推测,2022年中国基因测序行业市场规模将突破150亿

  • 漫画:什么是 “模因” ?2021-05-18 23:51:57

     小灰 程序员小灰有关 “模因” 的故事话说很久以前,有一个老头名叫洪七公,他有10个儿子,10个女儿。洪七公拥有这么多的子嗣,个体的基因能够广泛传播,他是不是感到很满足呢?然而,洪七公还是有一个大大的遗憾:他是一位武功高手,生平最得意的武功是降龙十八掌,可是他的儿女资质不佳,没有人能领

  • 小数据撬动大基金,“黄金”数据库大盘点2021-05-15 12:53:23

    不得不感慨,现代信息技术造就的海量数据给了我们许多便利,越来越多的医学研究项目认识到数据的力量,将重心转移到数据上来。已发表数据可以利用起来,做新的分析挖掘,找出事物之间未曾发现的关联;或者整合零散的信息建立新的数据库;或开发新的算法,成为更有力的数据分析工具。这不,2017年国自

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