标签:sort unexpected end sh ped sed file error test
1、脚本只有10行,报第11行错误??
[root@centos79 test]# bash test.sh test.sh: line 11: syntax error: unexpected end of file [root@centos79 test]# cat -n test.sh 1 #!/bin/bash 2 3 #step1 check ped file 4 uniqn=$(sed 's/\r//g' outcome.ped | cut -d " " -f 7- | sed 's/ /\n/g' | sort -u | wc -l) 5 if [ $uniqn -gt 5 ] 6 then 7 echo "error, exception nucleotide: " 8 sed 's/^M//g' outcome.ped | cut -d " " -f 7- | sed 's/ /\n/g' | sort -u | grep -v [ATGC0]; 9 exit 10 echo "stage1 ok"
2、 原来是少了一个fi
[root@centos79 test]# cat test.sh #!/bin/bash #step1 check ped file uniqn=$(sed 's/\r//g' outcome.ped | cut -d " " -f 7- | sed 's/ /\n/g' | sort -u | wc -l) if [ $uniqn -gt 5 ] then echo "error, exception nucleotide: " sed 's/^M//g' outcome.ped | cut -d " " -f 7- | sed 's/ /\n/g' | sort -u | grep -v [ATGC0]; exit fi echo "stage1 ok" [root@centos79 test]# bash test.sh stage1 ok
标签:sort,unexpected,end,sh,ped,sed,file,error,test 来源: https://www.cnblogs.com/liujiaxin2018/p/15489002.html
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