标签：map Gene 基因 基因座 locus 注释 点击 GENE

GWAS研究中经常涉及到基因座（locus）的概念，下面简要介绍一下批量注释基因到基因座的方法。

1、单个基因注释到基因座

对于单个基因的基因座注释，比较简单，常用的工具有：UCSC Genome Browser、NCBI。

比如UCSC Genome Browser：

还有NCBI：

2、批量注释多个基因到基因座

下面介绍一个网页版的批量注释基因到基因座的工具：BioMart

进入网址：http://www.ensembl.org/biomart/martview

如下所示：

以人类为例，进入网站后，在CHOOSE DATABASE中依次选择Ensembl Genes 104、Human genes (GRCh38.p13)：

依次点击Filters、GENE，在GENE栏中选择基因格式，这里以HGNC symbol(s)为例，选择完毕后，在输入框中把基因名黏贴进去：

随后依次点击Attributes和GENE，在GENE栏中勾选Chromosome/scaffold name、Gene start (bp)、Gene end (bp)、Karyotype band、Gene name:

最后，点击左上角的Results，结果如下所示：

可以看到，Karyotype band这一列就是我们要的基因座信息，最后点击Go就可以把结果下载下来啦。

致谢橙子牛奶糖（陈文燕），请用参考模版：We thank the blogger (orange_milk_sugar, Wenyan Chen) for XXX

感谢小可爱们多年来的陪伴， 我与你们一起成长~

标签：map,Gene,基因,基因座,locus,注释,点击,GENE
来源： https://blog.csdn.net/wendy_milk/article/details/120144688

本站声明： 1. iCode9 技术分享网（下文简称本站）提供的所有内容，仅供技术学习、探讨和分享；
2. 关于本站的所有留言、评论、转载及引用，纯属内容发起人的个人观点，与本站观点和立场无关；
3. 关于本站的所有言论和文字，纯属内容发起人的个人观点，与本站观点和立场无关；
4. 本站文章均是网友提供，不完全保证技术分享内容的完整性、准确性、时效性、风险性和版权归属；如您发现该文章侵犯了您的权益，可联系我们第一时间进行删除；
5. 本站为非盈利性的个人网站，所有内容不会用来进行牟利，也不会利用任何形式的广告来间接获益，纯粹是为了广大技术爱好者提供技术内容和技术思想的分享性交流网站。