标签：splicing ggplot GenomicFeatures 可视化 ggbio ggplot2 gene event

见上篇：genome browser | ggplot | 基因组可视化 | R | transcript | isoform

新需求（画出Fig 4D上面的辅图）：

山寨版，分析解构：

• 首先去method里找，完全没写是什么工具画的，那就猜吧；
• 其次看配色和对齐方式，基本肯定是ggplot画的，但仍然查不到是什么工具；
• 最后，能猜到这是卡通图，并不是真实的数据（exon的长度过于平均）；
• 优点：辅图一目了然的AS event可视化，这种barplot的可视化（颜色对应，PSI和为1）更加易读，可以看出作者在AS可视化上的功底；
• 细节也很到位：箭头和UTR

做一个API，自动读取AS event格式，添加箭头和UTR，以后可以常用。

待续~

参考：

• "ggplot2 exercise" drawing gene structure diagram
• ggbio: visualization toolkits for genomic data
• ggscaleRanges
• Introduction to ‘gggenes’
• Example Needed: Using arrow() with ggplot2

标签：splicing,ggplot,GenomicFeatures,可视化,ggbio,ggplot2,gene,event
来源： https://www.cnblogs.com/leezx/p/15040322.html

本站声明： 1. iCode9 技术分享网（下文简称本站）提供的所有内容，仅供技术学习、探讨和分享；
2. 关于本站的所有留言、评论、转载及引用，纯属内容发起人的个人观点，与本站观点和立场无关；
3. 关于本站的所有言论和文字，纯属内容发起人的个人观点，与本站观点和立场无关；
4. 本站文章均是网友提供，不完全保证技术分享内容的完整性、准确性、时效性、风险性和版权归属；如您发现该文章侵犯了您的权益，可联系我们第一时间进行删除；
5. 本站为非盈利性的个人网站，所有内容不会用来进行牟利，也不会利用任何形式的广告来间接获益，纯粹是为了广大技术爱好者提供技术内容和技术思想的分享性交流网站。