Linux操作系统主要就是一些配置文件和一些命令行工具，要掌握操作系统的主要目录结构和配置文件，运用系统的命令行工具完成常规的操作系统维护工作，监控工作。进而你可以安装部署一些企业应用，进行监控、管理等等。

把/etc目录下面常用的配置你都搞懂，把 /bin /sbin /usr/bin /usr/sbin下面常用的命令搞懂 会用shell编写常规的维护脚本

这样你已经非常厉害了。

linux 命令必须很熟悉，对find.sed,awk必须更熟悉，会正则。
了解unix编程，编译，知道gnu下的很多著名软件并会用。
example：m4,automake,autoconfig,binutils,gcc,...
能熟练试用vi,熟悉makefile...
可能的话掌握一种xwin开发方式gtk,qt等。
搞明白文件系统，能掌握50%以上/dev下设备干吗用的，并会用。
能知道/var下都有哪些重要东西。
熟悉/etc下的配置，了解常见的服务的配置
example:
squid,apache,natd,named,ftpd,sshd,xinetd
知道启动的时候unix按哪些顺序启动，并配置服务
C语言。
知道怎么安装软件
不仅仅是pkg_add,rpm,
知道怎样监控进程，网络
知道怎么追踪core
这些都熟悉了，基本算unix初通了，能做个unix初级使用者

看你想达到什么层次了，我个人的理解是：

初级：熟练使用命令、熟悉Shell编程、能配置简单的服务，清楚各类服务相关的配置文件的位置，
能看懂并可修改系统提供的配置脚本（/etc/*.*）
推荐书籍：
《鸟哥的私房菜基础篇、高级篇》
《Advanced Bash Shell》

中级：熟悉TCP/IP原理、OS原理、熟练使用C语言、Linux系统编程、网络编程。
推荐书籍：
《The C Programming Language》
《Unix环境高级编程》
《Linux程序设计》
《TCP/IP协议详解卷一》
《Unix网络高级编程》

高级：
《Linux Device Driver》
《深入理解Linux内核》
《深入理解计算机系统》
《深入理解LINUX网络内幕》

上面这些书单中，是我们公司一个玩Kernel的牛人开出的。
任何知识的学习都不是一蹴而就的，需要反复实践，反复理解。
祝你成功！

linux业内有句话，《深》为纲、《情》为目。情指的是情景分析，一本经典读物。情景分析很难，本身也需要读者有一定的天赋。不建议linux初学者阅读，很容易迷失方向。本身这本书更多是当你遇到问题的时候，希望能深入的探究缘由，读其中的某个章节。