标签:KEGG 网站 数据库 www 注释 kaas https KAAS
1. KEGG
现在自己用到的KEGG数据库主要是功能注释,下面谈一下我再用KEGG 时候的经验吧。
首先在kaas上传数据做基因的注释。
我们用的是prokka
注释过后的faa
文件:是蛋白序列。
当然基因序列也可以。
kaas 比对网站
https://www.genome.jp/tools/kaas/
得到的结果会在kaas的网站:
上面图片的text文件是下面的内容:
打开html之后内容就是:
代谢通路图(ko):
K号信息:
另外在kobas上可以做kegg富集分析
https://www.jianshu.com/p/1b05500e4983 (可参考这个网站)
总觉得自己写的有很多偏差,心静不下来,就写的很不好。
但是坚持下去吧! 加油。。。
标签:KEGG,网站,数据库,www,注释,kaas,https,KAAS 来源: https://blog.csdn.net/hac_kill_you/article/details/120572242
本站声明: 1. iCode9 技术分享网(下文简称本站)提供的所有内容,仅供技术学习、探讨和分享; 2. 关于本站的所有留言、评论、转载及引用,纯属内容发起人的个人观点,与本站观点和立场无关; 3. 关于本站的所有言论和文字,纯属内容发起人的个人观点,与本站观点和立场无关; 4. 本站文章均是网友提供,不完全保证技术分享内容的完整性、准确性、时效性、风险性和版权归属;如您发现该文章侵犯了您的权益,可联系我们第一时间进行删除; 5. 本站为非盈利性的个人网站,所有内容不会用来进行牟利,也不会利用任何形式的广告来间接获益,纯粹是为了广大技术爱好者提供技术内容和技术思想的分享性交流网站。