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Java DNA碱基对

2021-02-22 14:57:56  阅读:227  来源: 互联网

标签:碱基对 片段 Java stringBuffer 碱基 基因 System DNA 配对


问题描述

生物的基因都是由4种不同的碱基构成,一般用A, T,G、c表示这4种碱基。碱基之间可以配对构成碱基对,在配对时只能A和T配对, G和c配对。配对的碱基对按某种顺序连接成螺旋的梯子状,组成了基因。

一般而言,表示一个基因只需要使用一测的碱T基序列即可。例如,使用AGTC来表示一个基因片段时,可知其对应的另一侧的基因片段是TCAG现在给了一段较长的基因片段L和一段较短的基因片段s,请问基因片段s是否能和L中的某一段正好配对。我们说一段基因能和另一段基因配对是指这段基因中的每个碱基和另一段中对应位置的碱基配对。因碱基具有方向性,因此在配对的时候不能倒序。例如,若L=ATCAAATCG, S=TTTAG,则S能和L中的一段正好配对,配对的段为AAATC,它是从L的第4个位置开始的。

例如,若L=ATCAAATCG, S=TTTAG,则S能和L中的一段正好配对,配对的段为AAATC,它是从L的第4个位置开始的。

代码
package Ring1270.pra.java01;
import java.util.Locale;
import java.util.Scanner;
/**
 * DNA base pairs * */public class C_01String {
    public static void main(String[] args) {
        Scanner scanner = new Scanner(System.in);
        System.out.printf("Input system DNA:");
        String L = scanner.nextLine().toUpperCase(Locale.ROOT);
        System.out.printf("Input your DNA:");
        String S = scanner.nextLine().toUpperCase(Locale.ROOT);
        StringBuffer stringBuffer = new StringBuffer();
        char[] C = S.toCharArray();
        for (int i = 0; i < C.length; i++) {
            if ('A' == C[i]) {
                C[i] = 'T';
                stringBuffer.append(C[i]);
                continue;
            }
            if ('T' == C[i]) {
                C[i] = 'A';
                stringBuffer.append(C[i]);
                continue;
            }
            if ('C' == C[i]) {
                C[i] = 'G';
                stringBuffer.append(C[i]);
                continue;
            }
            if ('G' == C[i]) {
                C[i] = 'C';
                stringBuffer.append(C[i]);
                continue;
            }
        }
        System.out.println(stringBuffer);
        System.out.println(L.indexOf(String.valueOf(stringBuffer)) + 1);
    }
}

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标签:碱基对,片段,Java,stringBuffer,碱基,基因,System,DNA,配对
来源: https://blog.csdn.net/weixin_43388956/article/details/113938727

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