ICode9

精准搜索请尝试: 精确搜索
首页 > 编程语言> 文章详细

MCscan-Python-jcvi 共线性画图最后一章更新

2020-11-17 12:01:20  阅读:520  来源: 互联网

标签:共线性 15 reference Python 基因 jcvi 物种 MCscan species


经过几轮调试和修改,共线性图终于可以上眼了。如下:

 

 图中红色的为目标基因,蓝色的为reference species目标基因周围15个基因,天蓝色为再往外15个基因,黄色为与reference species存在的共线性,灰色为相邻物种间的共线性。

标注有物种信息,scaffold信息,并用颜色加以区分物种的不同属性。

最后一章的代码和思路更新见公众号。

 

接下来公众号将继续更新R画图和文献等内容。

 

 

标签:共线性,15,reference,Python,基因,jcvi,物种,MCscan,species
来源: https://www.cnblogs.com/abysw/p/13986829.html

本站声明: 1. iCode9 技术分享网(下文简称本站)提供的所有内容,仅供技术学习、探讨和分享;
2. 关于本站的所有留言、评论、转载及引用,纯属内容发起人的个人观点,与本站观点和立场无关;
3. 关于本站的所有言论和文字,纯属内容发起人的个人观点,与本站观点和立场无关;
4. 本站文章均是网友提供,不完全保证技术分享内容的完整性、准确性、时效性、风险性和版权归属;如您发现该文章侵犯了您的权益,可联系我们第一时间进行删除;
5. 本站为非盈利性的个人网站,所有内容不会用来进行牟利,也不会利用任何形式的广告来间接获益,纯粹是为了广大技术爱好者提供技术内容和技术思想的分享性交流网站。

专注分享技术,共同学习,共同进步。侵权联系[81616952@qq.com]

Copyright (C)ICode9.com, All Rights Reserved.

ICode9版权所有