标签:bin tar xe studio vasp VASP parallel 安装 CPU
VASP(Vienna Ab initio Simulation Package)由维也纳大学Hafner小组开发,进行电子结构计算和量子力学、分子动力学的模拟软件包。是目前材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商用软件之一。
本文是在intel parallel studio xe环境编译,intel parallel studio xe自带BLAS、FFTW、MPI等,parallel studio xe是商业软件,也可以使用GCC、OpenMPI、FFTW、OpenBLAS、ScaLAPACK组合编译,性能不比parallel studio xe差;
1、安装parallel studio xe 2019
配置Intel编译器、MKL、MPI环境
# source <intel_compiler_dir>/bin/compilervars.sh intel64
# source <intel_mkl_dir>/bin/mklvars.sh intel64
# source <intel_mpi_dir>/intel64/bin/mpivars.sh intel64
验证Intel编译环境
# which icc ifort mpirun icpc mpiifort
2、生成libfftw3xf_intel.a库文件
# cd <intel_mkl_dir>/interfaces/fftw3xf # make libintel64
3、安装VASP
# tar xf vasp.5.4.4.tar.gz # cd vasp.5.4.4 # cp arch/makefile.include.linux_intel ./makefile.include # make all
makefile.include文件的OFLAG参数里可以加入部分CPU指令集优化(如果AVX),使得编译出的程序能够利用主机CPU支持的最高指令集以加速计算,
编译完成后,会在vasp.5.4.4/bin目录里生成vasp_gam、vasp_ncl、vasp_std三个文件。
4、VASP测试
# export PATH=$PATH:/software/vasp.5.4.4/bin # wget https://files.cnblogs.com/files/liu-shaobo/benchmark.Hg.tar.gz # tar -xzf benchmark.Hg.tar.gz # cd vasp.Hg # mv IN-short INCAR
# mpirun -np 4 vasp_std
查看输出文件OUTCAR
标签:bin,tar,xe,studio,vasp,VASP,parallel,安装,CPU 来源: https://www.cnblogs.com/liu-shaobo/p/13727145.html
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