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python-从文件预分配的numpy数组?

2019-12-08 07:09:40  阅读:415  来源: 互联网

标签:performance arrays memory-management python numpy


我有一组进入numpy数组的大型ascii数据文件.总的来说,我的意思是390行,其中每行是60,000个值(从C程序高精度输出的双精度值),以空格分隔.

目前,我正在使用以下(朴素的)代码:

import numpy as np
data_array = np.genfromtxt('l_sim_s_data.txt')

但是,这需要25秒钟以上的时间才能运行.我怀疑这是由于在读取值之前未预分配data_array.是否有任何方法可以告诉genfromtxt它正在制作的数组的大小(因此将对内存进行预分配)?还是有人对如何加快这一过程有想法?

解决方法:

您是否尝试过np.loadtxt

(genfromtxt是更高级的文件加载器,可处理诸如缺少值和格式转换器之类的事情.)

标签:performance,arrays,memory-management,python,numpy
来源: https://codeday.me/bug/20191208/2089647.html

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